小儿癫痫的病因上可将癫痫分作两大类：一类是没有明确病因的癫痫，因此也称作隐源性癫痫或遗传性癫痫。这一类癫痫占癫痫患者的少部分，这类患者大多与遗传有关。另一类是可查出明确病因的癫痫，虽然小儿癫痫的病因十分复杂，但随着医学科技的快速发展，大部分病因已被人们明确认识。

1、高热惊厥后脑损伤也导致癫痫。

2、脑血管病：如颅内出血、脑血管畸形、脑梗塞、脑血管炎等。

3、遗传代谢病，如高氨血症，苯丙酮尿症，维生素b6依赖症，脑脂质沉积症等遗传癫痫。

4、营养代谢障碍及内分泌疾病，常见有的低血钙、低血糖、维生素b6缺乏、低血镁，甲状腺功能低下。

5、神经皮肤综合症：最常见的有神经纤维瘤病，结节性硬化和脑三叉血管瘤病等。

6、颅内感染：如病毒性脑炎、细菌性脑膜炎、霉菌性脑膜炎、脑脓肿、接种后脑炎、脑寄生虫病、传染后脑炎等。

7、围产期脑损伤，主要是窒息、产伤、缺氧、颅内出血、缺血性脑病，中其以缺氧缺血性脑病而致癫痫者最常见。

8、外伤：由外伤而致的颅骨骨折、颅内出血、脑挫裂伤等均可引起癫痫，但发病率与损伤程度及部位有关。

9、颅内感染：如病毒性脑炎、细菌性脑膜炎、霉菌性脑膜炎、脑脓肿、接种后脑炎、脑寄生虫病、传染后脑炎等。

10、围产期脑损伤，主要是窒息、产伤、缺氧、颅内出血、缺血性脑病，中其以缺氧缺血性脑病而致癫痫者是最常见癫痫。

11、先天脑发育畸形，如巨脑回畸形，无脑回畸形，灰质异位症，多小脑回畸形，先天性脑积水，脑穿通畸形，蛛网膜囊肿，肼胝体发育不全，巨脑症，头小畸形等。